Metaassembler - ReadMe file 정리

 드노보 어셈블리다. (아마 레퍼런스 없이 지들끼리 어셈블 시키는 걸로 기억함.)
 여러 어셈블리 합쳐서 가장 좋게 만드는 거 ( 잡곡밥...)


메타 어셈블리를 동작시키는 2가지 방법이 있다.
-입력 파일을 .config 로 바꿔서 assemble 하는 방법
  MergeMetassemble 폴더가 만들어지고 결과 과정 다 저장됨.

-다른 방법은 모든  과정마다 동작? 수작업?

Where is the MANUAL???
https://sourceforge.net/projects/metassembler/files/Metassemble_manual.pdf/download

과정 
 1. Mapping ( bowtie2 )
 2. CE-statistic을 계산 ( mateAn ) 
 3. Whole Genome Alignment를 계산  이상한  Align 필터링. ( nucmer, delta-filter )
 4. 2번 3번 과정을 이용해서 Merging... ( asseMerge )
 5. 결과를 잘 추려내서 만듬.  ( meta2fasta )

 이 정도로 하면 될 거 같음. 메뉴얼 뒤쪽에는 툴에 대한 사용법이니 기록하지 않겠음. 

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